[Todos] RECORDATORIO- Seminarios conjuntos IFIBYNE-DFBMC- jueves 19/12. 12 Hs.Dr. Dr. Ignacio Schor

[Paula Felman]

Jueves 19 de diciembre 12 hs. en el aula de seminarios



Dr. Ignacio Schor Furlong lab Genome Biology Unit – EMBL Heidelberg


Tratando de entender la complejidad 
transcripcional a escala genómica durante el 
desarrollo embrionario de Drosophila

Para entender a nivel molecular el desarrollo 
embrionario en los metazoos es necesario 
comprender el funcionamiento de las redes 
genéticas que lo dirigen. Clásicamente, se 
consideran que los actores principales en dichas 
redes son factores de transcripción regulatorios 
tejido-específicos y las secuencias del DNA a las 
cuales se unen (enhancers y silencers). Si bien 
este rol central se mantiene en la visión actual, 
investigaciones posteriores incluyeron otros 
niveles de regulación, como ser regulación 
post-transcripcional, cambios en la cromatina y 
acción de miRNAs. Mi trabajo actual consiste en 
el estudio a escala genómica de otros aspectos 
novedosos de la regulación de la expresión 
génica: los diferentes tipos de promotores, la 
acción de los RNA no codificantes largos 
(lncRNAs) y la transcripción de los enhancers 
(eRNAs). El laboratorio Furlong ha estudiado por 
años los mecanismos moleculares que regulan el 
desarrollo embrionario in vivo. Para eso se 
utiliza como sistema modelo el desarrollo del 
mesodermo en la mosca Drosophila melanogaster. 
Fruto del trabajo del grupo, disponemos de una 
gran cantidad de datos en diferentes estadios en 
este tejido, tales como sitios de unión de los 
factores de transcripción claves, actividad de 
enhancers, marcas de cromatina, etc. Si bien es 
un trabajo en progreso, presentaré en principio 
los sets de datos que generamos para este 
propósito, que incluyen bibliotecas de sitios de 
inicio de transcripción en diferentes estadios 
para decenas de líneas de moscas (de forma de 
poder realizar un estudio de asociación a escala 
genómica) y bibliotecas de RNAseq direccional a 
partir de RNA total de células de mesodermo 
depletado de rRNA. Finalmente, a partir de 
nuestros análisis preliminares, voy a contar las 
nuevas preguntas que podemos hacernos y los 
esfuerzos que estamos realizando para integrar estos datos.

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