[Todos] SEMINARIO QB 2014 - LUNES 30 de junio 13:00 h - Josefina Ocampo
Claudia Sepúlveda
claudia en qb.fcen.uba.ar
Dom Jun 29 23:04:24 ART 2014
SEMINARIOS DEL DEPARTAMENTO DE QUÍMICA BIOLÓGICA
Lunes 30 de junio a las 13:00 h, Aula Cardini del Departamento de Química
Biológica, 4to piso.
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Expositor: Dra. Josefina Ocampo
Laboratory of Molecular Growth Regulation, Program in Genomics of
Differentiation, Eunice Kennedy Shriver National Institute for Child Health
and Human Development (NICHD), National Institutes of Health (NIH).
"Los complejos remodeladores de cromatina ISW1, ISW2, CHD1 y RSC tienen
efectos aditivos en la estructura global de la cromatina en Saccharomyces
cerevisiae".
El mapeo de nucleosomas a lo largo del genoma de levadura ha revelado que
los mismos se encuentran regularmente espaciados y están en fase con
respecto al sitio de inicio de la transcripción. También se observó que la
mayoría de los genes tiene una región libre de nucleosomas en la región
promotora. En nuestro trabajo estudiamos cuatro complejos remodeladores de
cromatina en S. cerevisiae: ISW1, ISW2, CHD1 y el complejo esencial RSC; y
analizamos el rol que cada uno desempeñan en la organización de los
nucleosomas in vivo. Construimos cepas con el gen de la subunidad esencial
RSC8 bajo el control del promotor GAL y mutantes nulas para los genes
isw1, isw2 o chd1 en todas las combinaciones posibles dentro del mismo
background genético. En ausencia de RSC, los nuclesomas se desplazan hacia
el sitio de inicio de la transcripción, y como resultado la región libre
de nucleosomas se reduce mientras que el espacio entre nucleosomas se
conserva en ~165 pb. Previamente se demostró que se requiere la acción
conjunta de ISW1 y CHD1 para que los nucleosomas se mantengan en fase. En
este trabajo, confirmamos esta observación y mostramos que el espacio
entre nucleosomas en la mutante nula para isw1 está reducido en 6 bp (~159
bp), mientras que en la mutante nula para chd1 sólo se observan pequeños
cambios. Contrariamente, en la mutante nula para isw2 no se observa ningún
cambio. Los cambios observados en la estructura de la cromatina de las
mutantes doble, triple y cuádruple representan la suma de los efectos
observados en las mutantes simples, sugiriendo que los distintos complejos
remodeladores poseen roles diferentes. Proponemos que RSC determina la
posición del nucleosoma +1, y éste es luego utilizado como referencia por
CHD1 y ISW1 para construir las cadenas de nucleosomas de modo tal que CHD1
fija un espacio entre nucleosomas de 159 pb, que luego es incrementado a
165 pb por ISW1. Aunque 6 pb es sólo un pequeño cambio en la longitud del
ADN linker, se predice que este cambio tendría un gran impacto en los
niveles de organización superior de la cromatina debido a un importante
cambio en la orientación de nucleosomas vecinos.
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Traigan su almuerzo y nosotros invitamos el café. Los esperamos!
Martín Edreira
Diego Grinman
Diego Laderach
Claudia Sepúlveda
Organizadores de los Seminarios del Dpto. Química Biológica, FCEyN-UBA.
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